青藏公路、黑昌公路和黑阿公路(那曲至阿里)在那曲县境内交叉贯穿,交通条件得天独厚。青藏公路从北到南横贯那曲县境内,北面的德吉乡、南面的罗马乡、香茂乡、古路乡等四个乡政府的住址紧靠青藏公路主干线。黑昌公路(那曲至昌都)也从这里开端,蜿蜒向东至昌都地区丁青县,孔玛乡和达前乡人民政府紧挨在这条公路的主干线上,境内主要公路干线全长约500多公里。
那曲火车站是青藏铁路的中转站和补给站,是世界上海拔最高的火车站,境内丰富的旅游资源也很方便在短时间内集中游览。火车站位于那曲西面约两公里的门地乡俄玛迪格村,紧临青藏公路,车站主入口的雨篷造型正是羌塘地区毡房和雪山的形象反映。
那曲火车站由站房综合楼、货运仓库等几部分组成,总建筑面积7412平方米,其中综合楼建筑面积为2540平方米。