加查县位于西藏自治区东南部、雅鲁藏布江中游,县政区分布于雅鲁藏布江南北两岸。其东、北与林芝地区的朗县、工布江达县接壤;西接桑日、曲松两县;南与隆子县毗邻。国防公路东西向横贯县境,顺国防公路西行,距山南地区行署所在地泽当镇160公里,距自治区首府拉萨市350公里;东行,距朗县70公里。
全县公路从无到有,不断发展,相继建成了加查县城通往泽当、朗县以及县城至洛林乡、加查镇四乡两镇县乡公路,通往坝乡的公路已经进入施工阶段,预计今年年底全线贯通。现在,加查已经形成了以县城为中心,以县乡公路为脉络的交通运输网,公路通车里程达到237.11公里,全县行政村通路率达到60%。